归元寺面积很大，内部每一处都是一个奇妙的所在。

一、大雄宝殿

大雄宝殿位于中院，初建于清顺治十八年(1661)，大殿正中供奉着释迦牟尼坐像，两侧为其弟子阿难和迦叶像。　　佛像前的供桌高4丈8尺，横阔1丈2尺，深宽2.5尺，前嵌垂栏，宽1.5尺，高0.6尺，其间分为五格，深画镂空，图案描绘的是唐玄奘取经回长安时，君民夹道欢迎的场面，传这一樟木雕刻由十人历时一年才完成，是一件不可多得的木刻珍品。　　大雄宝殿前的韦驮殿内供奉着一尊木雕韦驮像，身着铠甲，手持宝杵，威武挺立，线条刀法都是唐朝风格，是归元禅寺的艺术珍品，也是中国雕刻艺术品中的一件宝贵遗产。

二、罗汉堂

罗汉堂位于寺院南院，始建于清道光年间，至今有二百年历史，堂内有罗汉五百尊，不仅在造型上别具一格，其塑造工艺也独具特色，或坐或立，或蹲或卧，或喜或怒，惟妙惟肖，各富情态，可谓千古杰作。民间有句谚语：上有宝光(成都)，下有西园(苏州)，北有碧云(北京)，中有归元(武汉)，是说这四个寺院的五百罗汉堂是最具代表性的，是佛教塑像的精华。

三、藏经阁

藏经阁位于北院，兴建于1920年至1922年，是一座两层五开间的楼阁式建筑，高约25米，整个建筑、门扇窗牖，涂朱绘彩，刻画镂雕，精巧壮观，金碧辉煌，是武汉市唯一一座砖木结构的古建筑物。这里珍藏着许多佛教文物，除《藏经》外，还有白玉佛像、各类经书七千多卷及印度、斯里兰卡、缅甸、泰国、日本等各国文字的佛经，极为珍贵。

四、双面观音

双面观音像是用80吨青铜历时近一年铸成的，雕像坐北朝南，分别由直径达30米的圆形基座和长50米的方形底坐托垫，体现了佛教天圆地方的宇宙观，基座及护栏全部由花岗岩雕凿而成，总高21.8米，为荆楚第一，雕凿工艺精湛，人物刻画细腻，线条流畅舒展，具有很高的艺术和鉴赏价值。