第一关BOSS
Brave Guerrier
这架由叛军和阿马迪乌斯加联合打造的飞艇，被用来运送部队到战场，并从任何射程提供支援火力。
分为多段攻击，不过玩家要是懂得套路都是非常简单的。第二关BOSS
Toschka Dalanue
这座武装塔是由阿马迪乌斯建立的，用来作为一个警戒点和一个防御基地，防止任何正规军深入。这个BOSS一共有五层，最下面是五区，最上面是一区，而一区则是一个假的艾伦在操作（后期证实是机器人）。
打败假艾伦之后，它会和基地一起爆炸得无影无踪


第三关BOSS
The Iron
玩家们都在奇怪，合金弹头虽然改头换面了，但是没有摩登将军的话怎么可能有原汁原味啊，于是在第三关我们终于见到了久违的摩登。
合金弹头4第三关的BOSS，就是合金弹头1五关BOSS改良版，阿马迪乌斯为了让坦克对场景地形更加适应，改造了这款设备，装备了坦克履带而不是车轮，这样它可以在任何地形上移动得更快，并且拥有更先进的装甲和火力。
另外，在后期的《金属弹头》移动版中得到官方透露，这一代出现的艾伦和摩登都是假的，仅仅是阿马迪乌斯组织打造的机器人，用来迷惑玩家的。
但是玩家从摩登爽朗的笑声中似乎能够感受到，这特么就是真的啊！


第四关BOSS
Big John
BOSS最初是一个游乐园的一个正常的机器人，但是某一天它的控制权却被阿马迪乌斯组织取得，于是组织将这个机器人进行改造，但是外观仍然保持原样。

该组织就是通过这个机器人，投放大量的木乃伊病毒和丧尸病毒，将游乐园的游客变成了丧尸或者木乃伊。这些病毒就是之前叛军在摩罗十诫以及埃及古墓中取到的，被博士研究之后投放到人多的地方，试图制造混乱。不过，他们已经研究出了解药



第五关BOSS
这艘巨大的潜艇，可以轻易摧毁船只。
潜艇上面装载了加特林机枪，可以杀死任何存在于机上的人员，并用导弹驱散目标。它既可以秘密摧毁潜艇和船只，也可以正面攻击。是海洋作业非常霸道的工具


第六关BOSS
在摩登最倒霉的那些年，作为组织头目的阿马迪乌斯博士，他帮助摩登重新打造了新的武器装备，而摩登则帮助他建立了自己的军队。他是金属弹头4最终的BOSS。他控制着电脑主机。
最终关的BOSS由三部分组成。玩家必须打败它三次才算是完成任务。最终，博士被困在机器中出不来，玩家这时候为了逃命直接跑了。这位博士到底死没死就不清楚了

合金弹头-4有多少boss 扩展
有6个boss,合金弹头4（Metal Slug 4）于2001年出品，由于SNK公司破产，该作由Mega Enterprise公司以及playmore公司合作开发，风格和控制类似于以前的作品，两个新面孔的角色Trevor和Nadia将出现在开始阵容中。狙击手、刀手、直升机、坦克、吉普车、等各种作战对象都将出现在游戏中，游戏中将出现的武器有双管机枪、霰弹枪、喷火枪、火箭筒、铁蜥蜴等。
